《末日三问》的结局是 悲剧性的，具体解析如下：

动漫结局

男主角和女主角都死了。

小女孩与男主角和女主角没有直接关系，但长得与珂朵莉极其相似。

奈芙莲和威廉在剧情最后醒来，变成了最初的兽。

威廉无法控制这种力量，自愿被杀，最终也死了。

奈芙莲在威廉死后，守着他的尸体很久，并最终封印自己进入仓中。

小说结局

珂朵莉最终去世。

威廉和奈芙莲坠落地面，被卷入最初之兽制造的幻境中。

他们发现最初之兽是威廉曾经爱过的女孩爱尔梅莉亚，她因诅咒变成“兽”的源头。

威廉决定以“兽”的身份与商国对抗，并最终牺牲自己。

建议

情感共鸣：这个结局充满了悲剧色彩，建议读者在阅读或观看时要有充分的情感准备。

深刻主题：作品通过悲剧结局探讨了生命、爱情和牺牲等深刻主题，引人深思。

后续发展：小说中的小女孩在第二部小说中会继续出现，可能会为故事带来新的希望或转折。