是的，《恋恋笔记本》中的男女主角诺亚和艾丽最终是在一起的。尽管艾丽在故事开始时嫁给了一个富裕的军官，但她在老年时患上了失忆症，而陪伴在她身边的始终是她的初恋情人诺亚。在电影的结尾部分，艾丽恢复了记忆，并与诺亚一同离开人世，这表明他们最终走到了一起。这个结局突显了电影中爱情的主题，即真正的爱情能够超越时间和困境的考验，实现“执子之手，与子偕老”的美好愿景。