赵丽颖在拍摄《知否知否应是绿肥红瘦》时 确实怀孕了。以下是一些证据：

剧照和网友观察

有网友通过观察《知否》的剧照，发现赵丽颖的面容呈现出孕相，包括面部浮肿、鼻头宽大、法令纹明显等特征。

冯绍峰的公开声明

冯绍峰在拍摄《知否》期间和之后，多次在采访中提到两人已经同居，并间接暗示赵丽颖在拍摄期间已经怀孕。

官方宣布

冯绍峰在2019年1月24日正式宣布赵丽颖怀孕，随后赵丽颖也转发确认了这一消息。

停工休息

赵丽颖在《知否》杀青后停工休息，工作室表示她将有很长一段时间的休整期，这也引发了外界对她怀孕的猜测。

综上所述，赵丽颖在拍摄《知否知否应是绿肥红瘦》时确实怀孕了，并且这一事实得到了官方和多方确认。