《破云2吞海》的主要内容围绕两个主要角色——吴雩和步重华展开，他们共同面对和解决一系列复杂的犯罪案件。吴雩是一名卧底警察，而步重华则是他的上司，两人之间的关系从最初的互不理解逐渐转变为相互信任和尊重。故事背景设定在现代城市，涉及到的犯罪活动包括贩毒、网络犯罪等，案件背后隐藏着复杂的利益关系和权力斗争。

吴雩的故事始于他作为卧底金三角的经历，目的是摧毁塞耶贩毒集团。在成功执行多次任务后，他因一次行动失败而重伤，被迫接受新的身份，潜入全球通缉的大毒枭鲨鱼身边。与此同时，建宁市发生了一系列连环大案，这些案件似乎都与一种神秘的物质——蓝金有关。江停，作为前缉毒警，从植物人状态中醒来，开始寻找真相并自证清白。

严峫，建宁市公安局刑侦副支队长，与江停有着深厚的友谊，并在侦破案件的过程中扮演了重要角色。随着案件的深入，他们逐渐揭露了“马里亚纳海沟”这一暗网组织的真面目，以及它与另一个暗网组织“茶马古道”之间的权力争夺。

整个故事充满了悬疑和紧张，每一个案件都扣人心弦，同时也展现了主角们在黑暗中的挣扎和成长。最终，吴雩和步重华联手，成功地将犯罪分子绳之以法，并为社会带来了正义的曙光。