农夫山泉的合作公司包括但不限于以下几家：

北京万泰生物药业股份有限公司：

农夫山泉持有该公司73.31%的股份，钟睒睒为实际控制人。该公司专注于生物诊断试剂与疫苗研发及生产。

浙江养生堂天然药物研究所有限公司：

主要从事天然药物的研究与开发。

达意隆（002209）：

有投资者提问关于与农夫山泉的合作，公司回复称确实有业务合作。

拼多多：

农夫山泉在拼多多开设了官方旗舰店。

吉林长白山有限公司：

农夫山泉股份有限公司100%持股，经营范围包括食品销售、化妆品零售、休闲观光活动等。

养生堂控股公司：

在浙江省、吉林省、湖北省、广东省建立国际领先的现代化生产基地，生产销售农夫山泉系列饮料。

其他未明确提及的合作公司：

农夫山泉在不同业务领域都有投资和运营，可能还有其他未明确提及的合作公司。

这些合作公司涵盖了生物药业、天然药物研究、饮料生产、农业、休闲观光等多个领域，显示了农夫山泉在多元化业务布局上的广泛合作。