在《汤姆·索亚历险记》中，印江乔埃（Injun Joe）被锁在山洞里的原因是因为他杀害了鲁滨逊医生，并将罪名嫁祸给了莫夫·波特。具体情节如下：

犯罪动机：

印江乔埃与医生和波特一起盗墓，在过程中杀死了医生，并将罪名嫁祸给波特。

藏匿地点：

杀人后，印江乔埃将所有的钱都藏在了山洞里，并自己也躲进了山洞。

发现与救援：

汤姆·索亚和贝琪·撒切尔在山洞中发现了印江乔埃，并在经历了一系列冒险后成功逃脱。然而，印江乔埃由于被困在山洞里，最终被饿死。

法官的锁：

在汤姆和贝琪获救后，撒切尔法官为了防止其他人迷路，命人将洞口封住，并上了三把锁。

这个结局突显了印江乔埃因贪婪和罪行而最终自食恶果的命运，同时也反映了小说中对社会不公和人性堕落的批判。