万花山的牡丹有着丰富的历史和美丽的传说，具体由来可以归纳如下：

传说一：

万花山上的牡丹是天上王母娘娘的女儿四姐私自下凡种的。

传说二：

花木兰征战回来时，路过洛阳和长安，带回牡丹种子播在万花山的。

历史记载：

欧阳修的《洛阳牡丹记》中提到“牡丹出丹州、延州”，并指出当时延安的牡丹非常繁盛。

保护措施：

范仲淹被贬镇守延安时，制止了老百姓砍斫牡丹的行为，并组织人栽种柏树来保护牡丹。

野生牡丹：

万花山是中国四大牡丹原生地之一，有300多亩约5万余株野生牡丹，20多个品种，花色丰富。

综合以上信息，万花山的牡丹不仅历史悠久，而且有着美丽的传说和丰富的文化内涵。无论是天上仙女的赠予，还是花木兰带回的种子，万花山的牡丹都展现了其独特的魅力和重要性。