《穿越西元3000后》的大结局是 叶冰瑶和葳斯基一起回到未来。在漫画的最后一部分，叶冰瑶在对抗红色精灵时，她的芯片失控，导致她的时空力量扩大，形成了一个时空隧道。叶冰瑶通过这个隧道回到了自己的时空。然而，葳斯基·卡列金也穿过隧道找到了她，并与她度过了一天普通的男女朋友。最后，葳斯基要回到未来，叶冰瑶决定跟随他一起回到未来。

这个结局充满了情感和冒险，展现了叶冰瑶和葳斯基之间深厚的感情，同时也为故事画上了一个圆满的句号。