《还珠格格3》的主要角色结局如下：

永琪：

为了小燕子放弃了太子之位，离开皇宫，定居在大理。

小燕子：

跟随永琪去了大理。

尔康：

戒药成功，与紫薇重新在一起，并回到宫中。

紫薇：

与尔康结婚。

萧剑：

与晴儿在一起，并得到了太后的祝福。

晴儿：

与萧剑结婚。

慕沙：

放手成全了尔康和紫薇。

知画：

最终被永琪抛下，抱着绵亿苦追永琪，但永琪跟随小燕子离开。

这些结局构成了《还珠格格3》的主要故事线，展现了角色间的爱情、牺牲和成长。