鸡飞狗跳通常指的是狗。这个成语源自古代十二生肖的排列顺序，狗在十二生肖中排行第十一，与十二地支中的“戌”相对应，戌时指的是晚上七点至九点，也称为“狗时”。因此，鸡飞狗跳这个成语形象地描述了狗的活动，后来也用来形容事物杂乱无章、乱作一团的状态。

此外，虽然有些资料提到鸡飞狗跳也可以指代其他动物，如蛇或猪，但这些解释并没有广泛流传或被普遍接受。因此，在大多数情况下，鸡飞狗跳是指狗。