《战火中的青春》的故事背景主要涵盖了抗日战争时期和解放战争时期。具体来说，影片讲述了清华大学、北京大学、南开大学一群热血青年在抗日战争全面爆发后，辗转大半个中国，不畏枪林弹雨，不惧艰难困苦，坚定科学救国的信念，历经重重考验，在炮火硝烟中传承文化血脉，在艰苦环境中追寻救国之道的故事。同时，也有版本讲述了1947年解放战争时期，一个烈士的女儿、区小队长高山女扮男装参加人民解放军的故事。因此，《战火中的青春》涵盖了抗日战争和解放战争两个时期，通过不同时间线展现了青年人在战火中的青春岁月和成长历程。