《还珠格格》第三部的主要拍摄地是云南大理。据幕后采访透露，导演曾考虑前往故宫拍摄，但未获批准，因此最终选择在北京太庙和北京大观园拍摄皇宫外景，而主场景如小燕子与永琪生活的景阳宫及其他一些宫内场景则是在北京农学院里的摄影棚搭建的，即现在的农学院体育馆，也是《霸王别姬》的取景地。此外，剧中的一些美丽场景和外景也拍摄于云南大理，大理以其秀美的风光和淳朴的民风吸引了众多游人。