云南石柱形成的原因是多方面的，主要包括以下几点：

水的作用：

水是形成石林的最重要因素之一。由于石灰岩是一种可溶性岩石，水（特别是含有二氧化碳的水）可以溶解石灰岩，形成溶蚀作用。水沿着地表的裂隙渗透，逐渐将石灰岩溶蚀成各种形态，包括石柱、石芽、石峰等。

地壳运动：

地壳的抬升和沉降对石林的形成也有重要影响。地壳运动使得原本沉积在海底的石灰岩层抬升到地表，暴露在空气中，从而受到风化和溶蚀作用。此外，地壳运动还会在石灰岩中产生裂隙，这些裂隙为水和其他溶蚀物质提供了通道，进一步促进了石灰岩的溶解。

气候条件：

云南地区长期的温暖潮湿气候为石林的发育提供了有利条件。高湿度和丰富的降雨使得含有二氧化碳的水渗入石灰岩的裂隙中，加速了溶蚀过程。这种气候条件在地质历史上曾多次出现，为石林的最终形成奠定了基础。

生物作用：

生物在石林的形成过程中也起到了重要作用。植物和动物的根系可以进入石灰岩的裂隙中，进一步加速溶蚀作用。此外，微生物也会分解岩石中的有机物质，产生酸性物质，这些酸性物质可以与石灰岩发生反应，促进其溶解。

时间因素：

石林的最终形成是一个漫长的过程，需要经过数百万甚至数亿年的时间。在这漫长的时间里，各种自然因素相互作用，共同导致了石灰岩的逐渐溶蚀和侵蚀，最终形成了如今我们所看到的壮观的石林景观。

综上所述，云南石柱的形成是多种自然因素长期相互作用的结果，包括水的作用、地壳运动、气候条件、生物作用以及时间因素。这些因素共同作用，使得石灰岩逐渐被溶蚀成各种形态的石柱，最终形成了独特的喀斯特地貌。