《穿越西元3000后》的结局尚未明确，目前漫画仍在进行中。根据现有信息，结局存在以下可能性：

时间线回归

叶冰瑶在对抗红色精灵时因芯片失控变成时空隧道，最终与葳斯基·卡列金一起回到原时空。但此情节存在争议，部分读者认为故事可能延续至未来。

开放式结局

叶冰瑶与葳斯基在宇宙尺度的时间中各自追寻，葳斯基留下未完成的时空装置，暗示两人可能在不同时间线重逢。部分读者猜测叶冰瑶可能通过类似装置回到未来，但具体细节尚未明确。

角色发展延续

小说中其他角色如离、姬怜美、季风之隐等也有重要戏份，暗示主线故事可能通过支线发展延续。

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