《新还珠格格》第三部的结局如下：

永琪的选择：

永琪选择放弃皇位，跟随小燕子、萧剑和晴儿回到云南大理，过上了平静的生活。他们在大理隐居，并且晴儿和小燕子分别生下了孩子。

尔康和紫薇：

尔康成功戒掉毒瘾，恢复了武功，并与紫薇留在了皇宫。紫薇与知画成为了闺中密友，而东儿和绵亿则情同手足。

皇后的结局：

皇后娘娘病死在冷宫中，容嬷嬷也自杀随她而去。

乾隆的探访：

多年后，年迈的乾隆皇帝微服出行，来到大理看望永琪和小燕子等人。尔康陪同乾隆一同前往，但紫薇并未同行。

其他角色的结局：

慕沙放手成全了尔康和紫薇，使得他们最终重新聚在了一起。期间，他们举办了一个盛大的婚礼，然后紫薇和尔康回到了皇宫。

这个结局与老版《还珠格格》有所不同，老版中小燕子和紫薇最终留在了皇宫，而新版中她们则选择了在大理隐居。尽管结局有所不同，但新旧版的《还珠格格》都受到了观众的喜爱。

建议：如果你对《新还珠格格》第三部感兴趣，建议观看这部剧以了解详细的情节和角色发展。