曹操的后人并没有被司马懿灭族。虽然司马懿通过高平陵政变诛杀了曹爽及其三族，但曹操的儿子燕王曹宇在政变后未被杀，晋朝建立后只是降封燕公。此外，曹操的其他子孙如曹彪、曹芳、曹髦、曹奂等也都有不同的结局，有的被废、有的被封为王，有的安度晚年，并没有全部被杀光。

尽管司马懿及其后代在政治上取得了巨大的成功，最终篡夺了曹魏的政权并建立了晋朝，但他们的统治并不得人心，最终导致了司马家族的覆灭。刘裕作为南朝刘宋的开国皇帝，曾经诛灭了司马家族，但这与曹操后人的命运无直接关系。

因此，从历史事实来看，曹操的后人并没有被司马懿灭族。