《穿越西元3000后》的大结局存在多个版本，具体如下：

版本一

叶冰瑶在对抗红色精灵时，芯片失控，将她的时空力量扩大，变成了时空隧道。叶冰瑶回到了自己的时空。然而，葳斯基·卡列金也穿过隧道找到她，并与她度过了一天普通的男女朋友。最后，葳斯基要回到未来，叶冰瑶决定跟随他一起回到未来。

版本二

何小厉觉得自己找到了生命中的另一半，而张丽也沉浸在这段新的感情中。然而，张丽居然背着自己找其他的男人。这个结局似乎是一个开放式结局，许多细节尚未明确。

版本三

白凝冰眼光开阔，认为某种搭配已经过时。冰风龙卷欺负二转的倒也不差，但放到三转这个层次就有些勉强了，导致该缸单体泵线束开路。这个结局似乎与主要剧情无关，可能是某个支线故事的结尾。

版本四

瑶瑶喝醉晕倒在亭子里，葳斯基把她唤醒，并告诉她一切真相，让她陪他演一场戏，一起揭开玲美的真面目。他们成功揭开了玲美的真面目，原来她的记忆被改过，成为了火星的间谍（也是火星的头目）。在战争中，葳和季风之隐释放了恶魔之子的能量，大败火星军。战争结束后，葳需要喝血，背离发现了并给了他解药。葳带瑶瑶回到四季城堡，再一次找到了极光雪莲，并向她求婚。

版本五

男主恢复记忆和女主举行了婚礼之后，故事就结束了。后面的剧情反复无常，因此可以认为这是一个开放式结局。

综上所述，《穿越西元3000后》的大结局存在多个版本，有明确描述的也有开放式结局。建议读者根据自己的喜好选择关注不同版本的大结局。