关于《穿越西元3000后》的结局，综合不同来源的信息分析如下：

主要结局版本

根据漫画主线剧情，叶冰瑶在对抗红色精灵时芯片失控，利用时空力量回到原时空。随后，葳斯基·卡列金穿越至同一时空，两人经历短暂相处后，葳斯基选择返回未来，叶冰瑶决定与他共同回到未来。

其他结局分支

小鸢的结局：

漫画后期剧情揭示，原世界毁灭后，A国皇帝安排小鸢留下重建家园，她获得魔法书后选择留在西元3000年，承担保护广寒宫的责任。

角色关系说明：离博士、姬怜美、季风之隐等角色在主线结局中未与叶冰瑶有直接关联。

粉丝推测与争议

部分粉丝根据剧情发展推测，若叶冰瑶未选择返回原时空，可能与葳斯基共同面对未来。但这一情节未在官方主线剧情中明确提及，属于粉丝二次创作或推测性解读。

总结：

官方明确呈现的结局中，叶冰瑶与葳斯基共同回到未来；若考虑扩展剧情，小鸢的命运与叶冰瑶分道扬镳。